1. Protein Data Bank (PDB) - . Доступна по адресу: [(https://www.rcsb.org/)].
|
2. Protein Knowledgebases (UniProtKB) - . Доступна по адресу: [(https://www.uniprot.org/)].
|
3. RNAPol-CHiP - .
|
4. Sequence Database - База данных о нуклеотидных последовательностях из непроверенных экспериментальных данных.
|
5. Swiss-Prot - .
|
6. UniGene - База данных о нуклеотидных последовательностях из непроверенных экспериментальных данных .
|
7. Аб инитио (Ab initio) - от начала, из первых принципов - моделирование, основанное на законах физики без использования эмпирических данных.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
8. Алгоритм - набор правил с заданной логической последовательностью шагов (стандартных операций), представляющих собой этапы решения задачи.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
9. Алгоритм Нидлмена-Вунша - основанный на методе динамического программирования алгоритм поиска глобального выравнивания последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
10. Алгоритм Смита-Уотермана - основанный на методе динамического программирования алгоритм поиска локального выравнивания последовательностей. Главная особенность состоит в том, что все отрицательные счета, вычисленные по матрице динамического программирования, заменяются нулями, чтобы избежать продол- жения выравниваний с плохим счетом и облегчить поиск (по этой матрице) локальных выравниваний, начинающихся и заканчи- вающихся в любых заданных позициях.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
11. Аллели - формы одного и того же гена, находящиеся в одном и том же месте (локусе) гомологичных (парных) хромосом и влияющие на проявление одного альтернативного признака.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
12. Алфавит - общее число знаков (букв), принятых для описания последовательностей. Алфавит ДНК содержит 4 буквы, а алфавит белков - 20 букв.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
13. Аналоги - в филогенетике к ним относят негомологичные белки, которые обладают подобным строением глобул или подобными функциональными участками и которые, как полагают, возникли в резуль- тате сходящейся эволюции.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
14. Аннотация - 1) совокупность комментариев, примечаний, ссылок и справок, которые организованы в произвольном формате или в виде управляемого словаря и в совокупности описывают всю эксперимен- тальную информацию и теоретические выводы о гене или белке.; 2) процесс маркировки генов и других и других объектов в последовательности ДНК; [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011; Несговорова, 2012]
|
15. Апплет - маленькая прикладная программа, загружаемая с сервера через HTML-страницы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
16. Ацетилирование - .
|
17. База данных - . [сост. Назаров В.В., источник: ]
|
18. База данных белков NCBI (англ. ncbi protein database) - База данных белков представляет собой набор последовательностей из нескольких источников, включая переводы из аннотированных областей кодирования в GenBank, RefSeq и TPA, а также записи из SwissProt, PIR, PRF и PDB. Белковые последовательности являются фундаментальными детерминантами биологической структуры и функции. Доступна по адресу: [(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein)].
|
19. Белковыe комплексы - . Метод протеомных исследований.
|
20. Белковый сплайсинг - .
|
21. Библиотека кДНК - библиотека генов, собранная из фрагментов кДНК, синтезированных по матрице мРНК с помощью обратной транскриптазы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
22. Библиотека клонов - неупорядоченное собрание клонов (то есть клонированная ДНК некоторого организма), полученных из геномной ДНК или кДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
23. Биоинформатика - наука о хранении, извлечении, организации, анализе, интерпретации и использовании биологической информации.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
24. Бит - двоичный знак (от англ. binary digit). [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
25. Бит информации - минимальное количество информации, необходимое для обозначения двух равновероятных возможностей (определе- ние из теории информации). Число битов информации N, требуемое для передачи сообщения, содержащего M возможностей, равно log2 M-N битов. Впервые слово "bit" было использовано Шенноном для логарифмической единицы информации в 1948 г. в статье "A Mathematical Theory of Communication".. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
26. БЛАСТ - программа для поиска подобия в базах данных последовательностей, BLAST.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
27. Блок - не содержащий пропусков, мотив выравнивания, состоящий из сегментов последовательности, которые группируют, чтобы уменьшить кратный вклад от групп сильно подобных или иден- тичных последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
28. Бренность информации - свойство, определяемое фиксируемостью информации. Свойство бренности позволяет говорить о сроке жизни информации, который зависит от состояния её носителя.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
29. Варианты сращения - белки различной длины, синтезированные путём трансляции молекул мРНК, собранных из произвольных разнове- ликих выборок экзонов из матричной ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
30. Вверх - направление считывания последовательности молекулы ДНК, обратное направлению транскрипции.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
31. Вдова - остаток аминокислоты, отделенный от соседних остатков ложными пропусками; как правило, результат чрезмерно усердной вставки пропусков программами автоматического выравнивания.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
32. Вектор экспрессии - клонирующий вектор, который конструируют для осуществления экспрессии белка с кДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
33. Вестерн-блоттинг - метод опознавания антигенов в смеси белков с помощью специфических антител.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
34. Вставка - или инсерция (от англ. insertion). [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
35. Всуд - вставка/удаление (insdel, от англ. insertion/deletion) в последовательности ДНК или белка.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
36. Вторичная база данных - база данных, которая содержит информацию, полученную путём обработки первичных данных о последовательности и представленную, как правило, в форме регулярных выражений (комбинаций), индикаторов, блоков, профилей или скрытых марковских моделей. Эти абстракции представляют собой экстракт наиболее консервативных особенностей множественных выравниваний и, таким образом, вполне могут быть надёжными дискриминаторами для определения принадлежности недавно расшифрованных последовательностей к семействам.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
37. Вторичная структура белка - упорядоченное строение полипептидных цепей, обусловленное внутрибелковыми водородными связями между группами С=О и N–H разных аминокислот.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
38. Вторичная структура РНК - обусловлена комплементарным связыванием между участками самой одноцепочечной молекулы РНК или между двумя молекулами РНК. Вторичная структура РНК не так регулярна, как у ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
39. Выборка - множество элементов, выбранных для исследования из множества данных с помощью определённой процедуры.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
40. Выравнивание - взаимное расположение двух или более последовательностей нуклеотидов или аминокислотных остатков, при котором число совпадающих мономеров является возможно максимальным.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
41. Выравнивание последовательностей - линейное сравнение последовательностей, в которые вводятся пропуски, чтобы передвинуть совпадающие позиции в сопоставленных последовательностях в правильный столбец так, чтобы по возможности большее количество одинаковых или близких мономеров оказались друг над другом. При этом разрешается удалить некоторые фрагменты сравниваемых последовательностей, удаленные фрагменты называются делециями. Выравнивания составляют основу методов анализа последовательностей и используются для точного определения места появления консервативных мотивов.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
42. Гаплоид - организм (клетка, ядро) с одинарным (гаплоидным) набором хромосом.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
43. Ген - фундаментальная физическая и функциональная единица наследственности. Ген представляет собой упорядоченную последовательность нуклеотидов, расположенную в определённой области определённой хромосомы и кодирующую специфический функциональный продукт (то есть молекулу белка или РНК).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
44. Генерация информации - выбор варианта, сделанный случайно (без подсказки извне) из многих возможных и равноправных (т. е. из принадлежащих одному множеству) вариантов.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
45. Генетическая карта - изображение относительных позиций известных генов, или маркеров.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
46. Генетический алгоритм - особый алгоритм поиска, созданный по аналогии с механизмами эволюции. Алгоритм кодирует совокупность первичных решений, измеряет предопределённую пригодность каждого решения и выбирает из первичной совокупности решения с самой высокой пригодностью для воспроизведения.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
47. Генетический код - правила соотнесения четырёх оснований ДНК или РНК с 20 аминокислотами. С помощью трёх оснований (триплета, или кодона) можно закодировать 64 возможных последовательности. Каждый триплет уникально определяет одну аминокислоту, но одна аминокислота может быть закодирована несколькими кодонами (от одного до шести). Поэтому генетический код называют вырожденным.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
48. Генная онтология (англ. Gene Ontology, или GO) - биоинформатический проект, посвященный созданию унифицированной терминологии для аннотации[(см.Аннотация)] генов и генных продуктов всех биологических видов. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
49. Генный полиморфизм - обусловленные мутациями варианты кодонов в виде однонуклеотидных замен; вариабельность генов (популяционная и индивидуальная) в пределах одного вида.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
50. Геном - 1) наследственный аппарат организма; совокупность всех участков ДНК. Геном представляется в виде одной непрерывной последовательности нуклеотидов. Задача картирования (аннотирования) генома состоит в теоретическом определении границ кодирующих (белки или РНК) участков, координат регуляторных, связывающих и других функциональных областей.; 2) весь генетический материал в хромосомах организма определённого биологического вида; размер генома в целом определяется общим количеством пар нуклеотидов.; 3) совокупность генов, локализованных в одиночном наборе хромосом данного организма. Термин «геном» предложен Гансом Винклером в 1920 г.;
|
51. Геномика (англ. genomics; нем. Геномика) - раздел молекулярной генетики, изучает геном и гены живых существ. Занимается созданием карты метаболических сетей. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
52. Гибридизация - процесс соединения двух комплементарных нитей ДНК или нити ДНК с нитью РНК, приводящий к образованию молекулы в виде двойной спирали.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
53. Гиперссылка - активная перекрестная ссылка HTTP, которая связывает веб-документы посредством сети Интернет.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
54. Гипертекст - текст, содержащий вложенные ссылки (гиперссылки) на другие документы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
55. Гиперцикл - средство объединения самовоспроизводящихся единиц в новую устойчивую систему, способную к эволюции. Он построен из автокатализаторов, которые сочленены посредством циклического катализа, т. е. посредством ещё одного автокатализа, наложенного на систему.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
56. Гликозилирование - .
|
57. Глобальное выравнивание - процедура приведения в соответствие как можно большего числа знаков, распространяющаяся на всю длину двух и более последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
58. Гомология - 1) родство, обусловленное эволюционным процессом расхождения от общего предка. Гомология не является синонимом подобия. Гомология означает, конкретно, что последовательности и организмы, в которых они обнаружены, являются потомками общего предка.; 2) сходство основных структур и органов организмов, основанных на общем генетическом наследстве.; [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011; Несговорова, 2012]
|
59. Графовые мотивы (англ. graphlets) - элементы графов.
|
60. Графовый подход - .
|
61. Групповой анализ - метод объединения в группы наиболее подобных объектов, выбранных из более крупной группы соотнесенных объектов. Отношения определяются по некоторому критерию подобия или различия.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
62. Гугол (от англ. googol) - число равное 10+100, такое, что никакая физическая величина не может иметь значение превышающее гугол.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
63. Двумерный электрофорез - . Метод протеомных исследований.
|
64. Действенность информации - будучи включенной в свою информационную систему, информация может быть использована для построения того или иного оператора, который может совершать определённые целенаправленные действия. Оператор, таким образом, выступает в роли посредника, необходимого для проявления действенности информации.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
65. Делеция - выпадение и потеря срединного участка хромосомы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
66. Диаметр графов - .
|
67. Динамическое программирование - метод сравнения и выравнивания строк или последовательностей по принципу, допускающему эффективное в вычислительном отношении введение пропусков.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
68. Дискриминатор - математическая абстракция консервативного мотива или набора мотивов (например, образец регулярного выражения, профиль или индикатор), используемая для поиска идентичного или подобного мотива (мотивов) или в отдельно взятой последовательности запроса, или в целой базе данных.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
69. Дисульфидных связей - .
|
70. Длина ветви - в анализе последовательностей длина ветви отражает число изменений последовательности, произошедших в ходе эволюции, направленной по данной ветви филогенетического дерева.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
71. ДНК-микрочипы - .
|
72. Докинг (молекулярный докинг) - это метод молекулярного моделирования, который позволяет предсказать наиболее выгодную для образования устойчивого комплекса ориентацию и положение одной молекулы по отношению к другой.. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
73. Домашняя страница - составленный на HTML документ, который служит первым пунктом контакта между программой-обозревателем и сервером.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
74. Дублирование гена - генетическое изменение, при котором отдельный сегмент ДНК повторяется. Дублирования могут появиться где угодно; если дублированный сегмент примыкает к оригинальному, то такое дублирование называют тандемным.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
75. Е-значение - (E-value от англ. expectation value). [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
76. Жидкостная хроматография (FPLC, HPLC), - . Метод протеомных исследований.
|
77. Задача свертывания белка - задача определения механизма (алгоритма) свертывания белка в его конечную пространственную структуру, определяемую лишь информацией, закодированной в его первичной последовательности.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
78. Идиотип - карта упорядоченных по номеру и размеру хромосом клетки организма.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
79. Изменчивость информации - это свойство информации, позволяющее изменять количество и (или) семантику информации, но сохраняющее её смысл.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
80. Ин силицо (In silico) - термин, обозначающий компьютерное моделирование (симуляцию) биологического эксперимента. Фраза была создана по аналогии с фразами in vivo (в живом организме) и in vitro (в пробирке), которые часто используются в биологии.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
81. Инвариантность информации - это возможность фиксации информации (записи) на любом языке, любым алфавитом.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
82. Индикатор - группа непрерывных мотивов, используемая для построения характеристических сигнатур принадлежности к определённому семейству. Такие группы непрерывных мотивов опознают в выравниваниях последовательностей при диалоговом поиске в первичной (или смешанной) базе данных.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
83. Инициатор - стартовый кодон, с которого начинается белок-кодирующий участок ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
84. Инсерция - перемещение (вставка) участков внутри хромосом.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
85. Интрон - .
|
86. Информация - запомненный выбор одного варианта из нескольких возможных и равноправных.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
87. Истинное несовпадение - несовпадение, правильно распознанное дискриминатором в качестве такового.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
88. Истинное совпадение - совпадение, правильно распознанное дискриминатором в качестве такового.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
89. Истинность информации - свойство, которое выявляется в ходе реализации полезности информации. Критерий истинности. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
90. Итеративный - предполагающий многократное выполнение последовательности операций.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
91. К-Кортежи - короткие идентичные отрезки последовательностей, называемые также словами.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
92. Карбоксилирование - .
|
93. Кариотип - схематически представленная характерная для вида совокупность морфологических признаков хромосом (число, размер, форма, детали строения и т. д.).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
94. Карты взаимодействия (между белками в клетке) - .
|
95. Кконсенсусная последовательность - обычно записывается под набором выровненных последовательностей и состоит из символов, характеризующих наиболее часто встречающиеся в колонке над этим символом варианты. Другими словами, это однозначный паттерн серии последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
96. Кладограмма - древовидная диаграмма, в которой каждый узел имеет две ветви; представляет эволюционную историю как процесс видообразования путём раздвоения эволюционных линий.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
97. Клон - генетически однородное вегетативное потомство одной особи.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
98. Клонирование - процесс производства идентичных копий некоторого фрагмента ДНК (который может кодировать целый ген), вырезанного из единственной матричной ДНК; также процесс создания идентичных копий клеток. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
99. Клонирующий вектор - молекула ДНК, сконструированная из части генетического материала вируса, плазмиды или клетки высшего организма, в которую может быть встроен фрагмент ДНК без нарушения способности вектора к саморепликации.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
100. Кодирующая последовательность - область ДНК или РНК, последовательность которой определяет последовательность аминокислот в белке.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
101. Кодон - последовательность трёх смежных нуклеотидов, которая кодирует либо определённый мономер (азотистое основание или остаток аминокислоты), либо стартили стоп-участок для механизма считывания.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
102. Количественная ПЦР - .
|
103. Компетенция - состояние организма (или органа) в котором он подготовлен к следующему акту морфогенеза. В терминах теории динамических систем компетенция соответствует состоянию, близкому к бифуркации.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
104. Комплементарное связывание - это связывание нуклеотидов, расположенных в разных цепях ДНК, которое обеспечивает связь двух полинуклеотидных цепей. Это связывание очень специфично: гуанин связывается только с цитозином, а аденин. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
105. Консенсус - обычно записывается под набором выровненных последовательностей и состоит из символов, характеризующих наиболее часто встречающиеся в колонке над этим символом варианты. Другими словами, это однозначный паттерн серии последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
106. Консервативная последовательность - последовательность оснований в молекуле ДНК (или последовательность аминокислот в белке), которая в ходе эволюции оставалась фактически неизменной.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
107. Контиг - contig (от англ. contiguous. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
108. Конформация - взаимное пространственное расположение атомов и связей в молекуле, обусловливающее её строение и, следовательно, функцию.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
109. Корневое дерево - филогенетическое дерево, в котором наименее общий предок всех биологических видов выделен в виде отдельного порождающего узла.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
110. Кортеж (в программировании) - в языках программирования со статической типизацией кортеж отличается от списка тем, что элементы кортежа могут принадлежать разным типам и набор таких типов заранее определён типом кортежа, а значит, и размер кортежа также определён.. [сост. Назаров В.В., источник: ]
|
111. Кортеж (в реляционных базах данных) - это элемент отношения. Для N-арного отношения кортеж представляет собой упорядоченный набор из N значений, по одному значению для каждого атрибута отношения.. [сост. Назаров В.В., источник: ]
|
112. КОСА - (количественное отношение структура-активность). Математическая функция, описывающая взаимосвязь между структурными особенностями молекулы и её биологической функцией.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
113. Коэффициент кластеризации - .
|
114. Кроссинговер - механизм обмена генами или комплексами генов гомологичных хромосом.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
115. Лиганд - любая маленькая молекула, которая связывается с белком или рецептором.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
116. Линейный штраф за пропуски - счет штрафа за пропуски, определяемый линейной функцией длины пропуска и состоящий из штрафа за введение пропуска и штрафа за продолжение пропуска, умноженного на длину пропуска.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
117. Логарифмический счет шансов - логарифм счета шансов.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
118. Ложное несовпадение - истинное совпадение, которое неправильно распознаётся дискриминатором в качестве несовпадения.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
119. Ложное совпадение - истинное несовпадение, неправильно распознаваемое дискриминатором в качестве совпадения.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
120. Локальное выравнивание - процедура выравнивания принадлежащих последовательностям областей с наивысшей плотностью совпадений, распространяющаяся на отдельные короткие отрезки обеих последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
121. Локус - участок генома, в котором расположен ген или генетический маркер.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
122. Максимальная экономичность - минимальное число эволюционных шагов, необходимых для воспроизведения наблюдаемых изменений в наборе последовательностей; определяют путём сравнения числа шагов во всех возможных филогенетических деревьях.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
123. Максимальное правдоподобие - наиболее вероятный исход (дерево или выравнивание) при вероятностном моделировании эволюционных изменений в последовательностях ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
124. Маркер - ген или участок ДНК с известной локализацией на хромосоме с определённым фенотипом, проявляющимся как свойства организма или самой молекулы ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
125. Массспектрометрия (фингерпринтинг молекулярных масс пептидов и тандемная массспектрометрия) - . Метод протеомных исследований.
|
126. Матрица BLOSUM - BLOcks Substitution Matrix. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
127. Матрица счетов PAM - Percent Accepted Mutation. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
128. Метаболизм (греч. metabole – перемена, превращение; англ. metabolism; нем. Metabolismus) - совокупность химических реакций, протекающих в живых клетках и обеспечивающих организм веществами и энергией для его жизнедеятельности,. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
129. Метаболомика - дает возможность понять, как происходит обмен веществ в клетке, изучить и смоделировать метаболизм, исследовать совместимость функций элементов биологической системы и, как следствие, ускорить процесс создания лекарственных препаратов.. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
130. Метилирование - .
|
131. Метод ESI - .
|
132. Метод SAGE - .
|
133. Метод дифференциального дисплея - .
|
134. Метод дробовика - Shotgun sequencing. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
135. Метод объединения соседей - метод объединения в группы подобных пар из набора родственных объектов; позволяет построить дерево, ветви которого отражают степени различия между этими объектами (гены с подобными последовательностями).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
136. Меченый участок последовательности STS - Sequence-Tag Site (МУП). [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
137. Микроматрица - миниатюрный прибор, называемый также чипом (микрочипом, биочипом), который содержит сотни или тысячи различных молекул, закрепленных на подложке в узлах регулярной сетки.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
138. Множественное выравнивание - это взаимное выравнивание многих последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
139. Монте-Карло - метод статистических испытаний, в котором общее решение сложной задачи отыскивается по совокупности возможных частных решений (случайных проб).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
140. Морфоген - фактор, способствующий образованию той или иной формы состояния компетенции. В качестве морфогенов могут выступать химические соединения (часто очень простые) и физические воздействия. Часто к одинаковому результату приводит несколько различных морфогенов.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
141. Морфогенез - образование новых пространственных форм при онтогенезе.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
142. Мотив - непрерывная цепь следующих друг за другом аминокислот в последовательности белка, общий характер которой повторяется (или сохраняется) в некоторой постоянной позиции всех последовательностей во множественном выравнивании.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
143. Мультипликативность информации - возможность одновременного существования одной и той же информации в виде идентичных копий на одинаковых или разных носителях.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
144. Мутация - скачкообразное изменение наследственного признака вследствие изменения генетического материала.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
145. Негеномные (постгеномные) данные - вэб-ориентированный автоматизированный метаанализ данных о сотнях транскриптов (или белков) в ходе одного эксперимента. [сост. Назаров В.В., источник: ]
|
146. Нейронная сеть - применяется в алгоритмах с элементами искусственного интеллекта. Абстрактная структура, состоящая из множества простых единиц, которым присвоены численные веса и которые содержат символьные данные. Каждая единица работает только с символьными данными, поступившими на её вход по связям с другими единицами.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
147. Нормализованная библиотека - библиотека кДНК, которая организована таким образом, что все гены в ней представлены с одинаковой частотой.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
148. Нуклеотидная база данных DDBJ (на японском) - База данных о нуклеотидных последовательностях из непроверенных экспериментальных данных.
|
149. Нуклеотидная база данных EMBL (англ. embl nucleotide sequence database) - База данных нуклеотидных последовательностей EMBL (http://www.ebi.ac.uk/embl), хранящийся в Европейском институте биоинформатики (EBI) близ Кембриджа, Великобритания, представляет собой полную коллекцию нуклеотидных последовательностей и аннотаций из доступных общедоступных источников. База данных является частью международного сотрудничества с DDBJ (Япония) и GenBank (США). Данные ежедневно обмениваются между сотрудничающими институтами для достижения быстрой синхронизации. Webin является предпочтительным инструментом для индивидуального представления нуклеотидных последовательностей, включая сторонние аннотации (TPA) и выравнивания. Автоматизированные процедуры предусмотрены для представления крупномасштабных проектов секвенирования и данных Европейского патентного ведомства. Новые и обновленные записи данных распространяются ежедневно, и вся база данных нуклеотидных последовательностей EMBL выпускается четыре раза в год. Доступ к данным последовательности обеспечивается через ftp и несколько интерфейсов WWW. С помощью веб-системы поиска последовательностей (SRS) также можно связать данные о нуклеотидах с другими специализированными базами данных молекулярной биологии, поддерживаемыми в EBI. Для поиска сходства последовательностей доступны и другие инструменты (например, FASTA и BLAST). Изменения, произошедшие за последний год, включают в себя удаление ограничения длины последовательности, запуск набора данных EMBLCDSs, расширение функциональности архива версий последовательности и пересмотр правил качества для данных TPA. Доступна по адресу: http://www.ebi.ac.uk/embl.
|
150. Нуклеотидная база данных GenBank - База данных о нуклеотидных последовательностях из непроверенных экспериментальных данных.
|
151. Нуклеотиды - фосфорные эфиры нуклеозидов, нуклеозидфосфаты. Свободные нуклеотиды, в частности, АТФ, АДФ, играют важную роль в энергетических и информационных внутриклеточных процессах. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
152. Объектно-ориентированная база данных - база данных, в которой данные хранятся в виде абстрактных объектов, связанных абстрактными же отношениями. Единицей хранения информации является не запись, как в реляционных базах данных, а объект. Форматы представления данных могут быть самыми разными, включая, например, строки знаков, оцифрованные изображения, таблицы и т. д. Комплексный объект может включать в себя множество других объектов, причем объектно-ориентированная база данных позволяет осуществлять выборку таких объектов как цельных элементов. Благодаря гибкой системе представления данных и возможности объединять объекты в группы, объектно-ориентированные базы данных являются мощными информационными системами.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
153. Ограниченный протеолиз - .
|
154. Однонуклеотидные замены - генные полиморфизмы, SNP.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
155. Омики (англоязычный неологизм; англ. omics) - общее обозначение биологических наук, оканчивающихся на "омика", таких, как геномика, протеомика, метаболомика, транскриптомика и пр.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
156. Онтогенез - последовательность всех этапов развития особи от возникновения зародыша до смерти особи или до полного отмирания всего её вегетативного потомства. Для начальных стадий онтогенеза принят термин эмбриогенез.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
157. Онтогенетическое состояние - определённый этап онтогенеза, характеризующийся специфическим физиолого-биохимическим состоянием, наличием ряда индикаторных морфологических и биологических признаков. Каждый этап онтогенеза характеризует биологический возраст особи.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
158. Онтология - описание отношений между объектами (особенно в системах искусственного интеллекта).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
159. Операционная система - программа или комплект программ для управления работой компьютера, контроля операций ввода/вывода, прерывания пользовательских запросов и т. д. (например: Windows, Unix, …).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
160. Оперон - участок ДНК, состоящий из регуляторных элементов - промотора, оператора и структурных генов. Детерминирует синтез белков-ферментов, осуществляющих последовательные биохимические реакции в организме.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
161. Описатель - слово (фраза), содержащее данные об отдельной последовательности или о наборе последовательностей; объём такой информации зависит от места описателя в записи.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
162. Оптимальное выравнивание - выравнивание с наивысшим счетом, построенное алгоритмом, способным к нахождению кратных решений. Это возможно лучшее выравнивание, которое может быть найдено для любого параметра, заложенного пользователем в программу выравнивания последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
163. Ортологи - гомологичные белки, которые синтезируются в организмах различных биологических видов, но выполняют аналогичные функции.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
164. Ортологичные гены - гомологичные гены, которые неодинаково эволюционировали у разных видов, имеющих общего предка.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
165. Открытая рамка считывания (ORF) - ряд кодонов ДНК (в том числе старт-кодон и стоп-кодон), кодирующий предполагаемый или известный ген.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
166. Паралоги - синтезируемые в одном организме гомологичные белки, которые выполняют различные, но связанные функции.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
167. Паралогичные гены - гомологичные гены, возникшие в результате дупликации и эволюционировавшие параллельно в одном и том же организме.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
168. Параметрическое выравнивание последовательностей - метод, позволяющий найти диапазон возможных выравниваний путём варьирования параметров системы очков за совпадения и несовпадения, а также штрафов за пропуски.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
169. Паттерн - (от англ. pattern. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
170. Пептиды (греч. peptos – сваренный, переваренный) - органические вещества, состоящие из остатков одинаковых или различных аминокислот, соединенных пептидной связью. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
171. Первичная база данных - база данных, содержащая последовательности биомолекул (белков или нуклеиновых кислот) и сопутствующие аннотации (организм, биологический вид, функция, мутации, связь с определёнными заболеваниями, функциональные и структурные комбинации, библиографические ссылки и т. д.).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
172. Первичная структура белка - последовательность расположения аминокислотных остатков в полипептидной цепи.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
173. Петидом - .
|
174. Плоский файл - файл данных, предназначенный для обмена информацией между базами данных и представленный в удобном для человека формате. Плоские файлы могут быть созданы на базе реляционных баз данных и приведены к формату, подходящему для их загрузки в другие базы данных.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
175. Позиционная матрица счетов (ПМС) - (Position Weight Matrix (PWM), или Position-Specific Weight Matrix (PSWM), или Position-Specific Scoring Matrix (PSSM)). [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
176. Поиск мотивов совпадения - поиск совпадения короткой последовательности в одном или более отрезках длинной последовательности.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
177. Поисковая система Entrez - .
|
178. Поисковая система Expasy - .
|
179. Поисковая система MRS - .
|
180. Поисковая система SRS (англ. sequence retrieval system) - интегрированная система поиска по базам данных (GenBank, EMBL, DDBJ, RefSeq и т.д.).
|
181. Полезность информации - свойство информации, предполагающее, что она кому-нибудь нужна, может быть с пользой применена для некоторых целенаправленных действий. На основании свойства полипотентности можно утверждать, что полезной может оказаться любая информация.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
182. Полиморфизм отдельного нуклеотида (SNP) - изменение отдельного нуклеотида в последовательности ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
183. Полипотентность информации - это возможность использования оператора, закодированного данной информацией, для осуществления различных действий (т. е. для достижения разных целей).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
184. Попарное выравнивание - выравнивание последовательностей по парам.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
185. Последовательность запроса - последовательность ДНК, РНК или белка, используемая в качестве образца для поиска в базах данных последовательностей с целью отыскать близкие или отдаленные члены семейства с известной функцией.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
186. Пост-трансляционные модификации (белков) - .
|
187. Правило - короткое регулярное выражение (обычно длиной 4-6 остатков), используемое для опознавания кодируемых геномом (без установленной принадлежности к семействам) комбинаций в последовательностях белка. Правила тяготеют к кодированию определённых функциональных участков (например, участков присоединения cахаров, фосфорилирования, гидроксилирования, сульфатации и т. д.). Однако их небольшой размер означает, что регулярные комбинации не могут быть хорошими дискриминаторами, а могут лишь служить подсказкой при решении вопроса о возможности существования в последовательности того или иного функционального участка.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
188. Праймер - короткий олигонуклеотид, к которому с помощью ДНК-полимеразы можно добавлять новые нуклеотиды.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
189. Предсказание структуры - процесс алгоритмического восстановления вторичной, третичной и даже четвертичной структуры белка по последовательности аминокислотных остатков.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
190. Продукт гена - белок, синтезируемый в ходе экспрессии гена. В некоторых случаях продуктом гена может быть молекула РНК, которая никогда не транслируется.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
191. Прокариот - организм, для которого характерно отсутствие ограниченного мембраной, структурно обособленного ядра (и других внутриклеточных полостей). Примером таких доядерных организмов служат бактерии.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
192. Промотор - регуляторный участок молекулы ДНК (80–90 пар нуклеотидов), с которым связывается РНК-полимераза, инициирующая транскрипцию.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
193. Промоторы - структурные элементы.
|
194. Пропуск - область выравнивания последовательностей, в которой одна из последовательностей не содержит никакого мономера.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
195. Протеолиз - .
|
196. Протеолиз in silico - . Метод протеомных исследований.
|
197. Протеом - 1) вся совокупность белков, синтезируемых с данного генома; сюда же относятся варианты одного и того же базового белка, появляющиеся в результате посттрансляционных модификаций.; 2) ; [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011; ]
|
198. Протеомика - наука изучающая первичную и пространственную структуру белков и особенности их функционирования в организме. Протеомика выросла из геномики.. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
199. Протокол связи - согласованный набор правил для стандартизации связи между программами.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
200. Протягивание - метод предсказания структуры белка, состоящий в выравнивании последовательности белка неизвестной структуры с моделью известной пространственной структуры; позволяет определить пространственную и химическую совместимость последовательности аминокислот с моделью известной структуры.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
201. Профиль - позиционная таблица счетов, в которую сведена информация о полном выравнивании последовательностей. Профили показывают, какие остатки могут находиться в данных позициях; какие позиции консервативны, а какие вырождены; которые позиции, или области, допускают вставки. В дополнение к данным, полученным из выравнивания, система очков может включать в себя эволюционные веса и результаты анализа структур. Дифференциальные штрафы предназначены для компенсации вставок и удалений, встречающихся в элементах вторичной структуры.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
202. Профиль экспрессии - характеристический набор генов, экспрессируемых в различных стадиях развития и функционирования клетки.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
203. Процент подобия - счет выравнивания последовательностей аминокислот; счета замен различных аминокислот ранжированы с помощью матрицы замен.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
204. ПЦР в реальном времени - .
|
205. Распределение степеней вершин - .
|
206. Регулярная комбинация - обнаруживаемые в биомолекулах регулярные комбинации, как правило, образованы мономерами, составляющими последовательность гена или белка.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
207. Регулярное выражение - отдельное согласованное выражение, полученное из консервативной области выравнивания последовательностей и используемое в качестве характеристической сигнатуры принадлежности к семейству. Синонимичные термины: правило, регулярная комбинация.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
208. Регулятивная область или последовательность - область в последовательности ДНК (или целая последовательность), которая управляет экспрессией гена.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
209. Реляционная база данных - база данных, построенная на реляционной модели данных (основанной на отношениях); данные организованы в двумерные таблицы. Таблицы описывают различные характеристики или свойства данных, но содержат избыточную информацию.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
210. Репрессор - регуляторный белок, контролирующий синтез (трансдукцию) мРНК с определённого оперона.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
211. Рестрикционная карта - вид физической карты, на которой указан порядок следования и расстояния между сайтами расщепления ДНК рестриктазами (обычно участок узнавания рестриктазы 4–6 bp). Маркерами этой карты являются рестрикционные фрагменты/сайты рестрикции.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
212. Рестрикционные фрагменты - фрагменты молекулы ДНК, которые образуются при разрезании её ферментами рестрикционными эндонуклеазами (рестриктазами).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
213. Рестрикционный портрет - характеристика молекулы ДНК по набору рестрикционных фрагментов, размер которых определяют на электрофореграмме, не составляя рестрикционой карты.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
214. РНК-интерференция - 1) ; 2) ;
|
215. Сайленсеры - структурные элементы.
|
216. Сайт связывания рибосомы (ССР) - участок вблизи 5'-конца матричной РНК, который служит рибосоме для прикрепления к мРНК в начале процесса считывания белка с матрицы мРНК. Прикрепившись, рибосома начинает движение по мРНК к 3'-концу, попутно транслируя каждый триплет в аминокислоту. ССР в прокариотах называется ещё сайтом Шайна-Дальгарно (по имени ученых, открывших его существование). Связывание осуществляет определённый тип рибосомальных РНК (так называемый 16S-pPHK), у которой на 3'-конце есть комплементарный ССР участок.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
217. Сборка - процесс выравнивания перекрывающихся фрагментов последовательности в одну НПО или в ряд НПО.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
218. Свойства (природных) графов - .
|
219. Сдвиг рамки считывания - изменение смысла считывания ДНК, возникающее в результате вставки или выпадения основания, при котором рамка считывания всех последующих кодонов смещается соответственно числу произошедших изменений (например, если к началу исходной последовательности, в которой читаются кодоны UCU-CAA-AGG-UUA добавить одно основание U, то новая последовательность будет читаться как UUC-UCA-AAG-GUU, и т.д.). Сдвиг рамки считывания может быть вызван появлением случайных мутаций или ошибок в чтении результатов секвенирования.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
220. Секвенирование - 1) определение порядка нуклеотидов (последовательности оснований) в молекуле ДНК или РНК, либо порядка аминокислот в белке.; 2) это определение первичной или аминокислотной, или нуклеотидной последовательности белков и нуклеиновых кислот: ДНК и РНК.; [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011; Несговорова, 2012]
|
221. Семантика - (от др.-греч. σημαντικός. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
222. Семантика (или содержательность) информации - проявляется в специфике кодируемого информацией оператора, причем каждая данная информация однозначно определяет оператор, для построения которого она использована.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
223. Семейства генов - группы тесно связанных генов, которые кодируют подобные белковые продукты.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
224. Сиквенс - последовательность нуклеотидов в фрагменте ДНК (от англ. sequence. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
225. Синтения - сохранение порядка следования генов в геномах (относительно) родственных организмов.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
226. Синтетический геном - .
|
227. Система выборки последовательностей (SRS) - Sequence Retrieval System – средство выборки данных.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
228. Системная биология - .
|
229. Скрытая марковская модель (HMM) - Hidden Markov model. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
230. Смешанная база данных - база данных, которая объединяет в себе множество первичных источников и использует набор заданных критериев, определяющих приоритет включения различных источников и необходимый порог избыточности.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
231. Смысловая трансляция - вычислительный процесс интерпретации смыслового содержания последовательности нуклеотидов мРНК и кодирования его с помощью генетического кода в последовательность аминокислот, которая далеко не во всех случаях будет описывать белок.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
232. Согласованная последовательность - псевдопоследовательность, которая содержит сводную информацию о расположении остатков, содержащуюся во множественном выравнивании.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
233. Сплайсинг - (от англ. to splice. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
234. Сравнительная геномика - наука о сравнении геномов различных организмов по числу генов, локусам и биологическим функциям генов; одна из целей состоит в определении групп генов, кодирующих уникальные для каждого организма биологические функции.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
235. Сравнительное моделирование - процесс предсказания структуры белка на основании сравнения с последовательностью родственного белка с известной структурой.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
236. Сумоилирование - .Присоединение других белков и пептидов.
|
237. Сходство - это наличие или измерение сходства и различия, независимо от источника сходства.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
238. Счёт выравнивания - счет, алгоритмически вычисленный по числу совпадений, замен, вставок и удалений (пропусков) в выравнивании. Счета выравниваний выражают в единицах логарифмов шансов, часто в двоичных единицах (логарифм по основанию 2).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
239. Счёт шансов - отношение правдоподобий двух событий, или исходов. Счёт шансов на соответствие знаков двух последовательностей (применяемый при оценке выравниваний последовательностей и получении матриц счетов) равен отношению частоты наступления событий выравнивания знаков в родственных последовательностях к частоте абсолютно случайного выравнивания тех же двух знаков при условии совместного появления этих знаков в последовательностях. Счета шансов для множества отдельных выровненных позиций вычисляют путём перемножения счетов шансов, найденных для каждой отдельной позиции. Счета шансов часто преобразуют к логарифмам и таким образом получают логарифмические счета шансов; тогда логарифмический счет шансов выравнивания целых последовательностей вычисляют путём суммирования отдельных логарифмических счетов шансов, что намного удобнее.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
240. Тандемная массспектрометрия - . Метод протеомных исследований.
|
241. Тандемные повторы - множественные копии идентичных последовательностей нуклеотидов, следующих один за другим в конкретном участке хромосомы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
242. Теория динамических систем - .
|
243. Теория информации - отрасль математики, предметом которой служит измерение количества информации в битах; бит определяет минимальное количество структурной сложности, необходимое для кодирования единичного объёма информации.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
244. Терминатор - стоп-кодон, которым заканчивается белок-кодирующий участок ДНК.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
245. Точечная матрица - анализ диаграммы точечной матрицы представляет собой графический метод сравнения двух последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
246. Транскрипт - однонитевая цепь мРНК, синтезированная по матрице-гену; набор полинуклеотидных цепей мРНК, представляющих собой комплементарную копию последовательности оснований цепи ДНК-матрицы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
247. Транскриптомика - 1) изучает активность генов, получает данные о концентрации десятков тысяч матричных РНК.; 2) картирование секвенированных фрагментов на геном; [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012; ]
|
248. Транскрипция - синтез комплементарной РНК по последовательности ДНК (гена); первый шаг экспрессии гена.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
249. Транслируемость информации - это свойство, противостоящее бренности информации, это возможность передачи информации с одного носителя на другой, т. е. размножение информации.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
250. Транслокация - любое перемещение хромосомных сегментов в наборе хромосом. Может быть внутрихромосомной или межхромосомной.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
251. Трансляция - 1) процесс, в котором генетический код, заложенный в мРНК, направляет синтез белков из аминокислот.; 2) ; [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011; ]
|
252. Трансляция in silico - . Метод протеомных исследований.
|
253. Трансляция с шестью рамками - трансляция отрезка ДНК, включающая в себя три трансляции в прямом и три. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
254. Трансмембранный домен - пронизывающая мембрану область белковой последовательности.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
255. Третичная база данных - база данных, содержащая обработанную информацию из вторичных баз данных (регулярных комбинаций). Ценность таких ресурсов состоит в том, что они обеспечивают альтернативную схему назначения счетов для фактически тех же самых первичных данных и дают возможность выявить отношения, которые могли быть пропущены при сравнительном анализе данных в исходной форме.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
256. Третичная структура - общая конфигурация последовательности белка, всех -спиралей и -структур белка, распределение в пространстве всех атомов белковой молекулы.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
257. Убиквитинилирование - .Присоединение других белков и пептидов..
|
258. Унифицированный указатель ресурса (URL) - адрес источника информации. Указатель URL состоит из четырёх частей. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
259. Уровни включения экзонов - .
|
260. Фаг (греч. fagos – пожиратель) - вирус, избирательно поражающий бактериальные клетки. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
261. Фаговый дисплей - .
|
262. Файл - обособленный набор байтов, которым можно манипулировать как цельным объектом.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
263. Фантомные всуды - ложные вставки или удаления, которые появляются, когда из-за физических неоднородностей в геле для секвенирования программа считывания или регистрирует какое-либо основание преждевременно, или же вообще пропускает проходящее мимо основание.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
264. Фармакоинформатика - отрасль информатики, изучающая вопросы управления биологической и химической информацией в фармацевтической промышленности.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
265. Феном - набор проявившихся наследственных признаков организма.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
266. Фермент - белок-катализатор, который увеличивает скорость протекания биохимической реакции, но при этом не изменяет её направление и характер.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
267. Физическая карта - графическое представление порядка следования физических маркеров (фрагментов молекулы ДНК), расстояние между которыми определяется в парах нуклеотидов.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
268. Фиксируемость информации - это свойство, благодаря которому любая информация, не будучи ни материей, ни энергией, может существовать не в свободном виде, а только в зафиксированном состоянии. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
269. Филогенетика - область биологической систематики, которая занимается идентификацией и прояснением эволюционных взаимоотношений среди разных видов жизни на Земле, как современных, так и вымерших. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
270. Филогенетическая систематика - область биологической систематики, которая занимается идентификацией и прояснением эволюционных взаимоотношений среди разных видов жизни на Земле, как современных, так и вымерших. [сост. Назаров В.В., источник: Несговорова, 2012]
|
271. Филогенетический анализ - изучение эволюционных отношений между организмом определённого вида и его предшественниками (например, с помощью филогенетических деревьев).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
272. Филогенетическое дерево - графическое представление предполагаемых эволюционных отношений между группами организмов; такие отношения могут быть установлены, например, путём множественного выравнивания последовательностей белков или нуклеиновых кислот.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
273. Фингерпринтинг молекулярных масс - . Метод протеомных исследований.
|
274. Фосфорилирование - .
|
275. Функциональная геномика - наука, занимающаяся оценкой функции генов, опознанных путём сравнения геномов. Функцию недавно опознанного гена проверяют путём введения в этот ген мутаций и последующего анализа изменений, произошедших в фенотипе полученного мутантного организма.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
276. Характеристика - аннотация на определённый отрезок последовательности.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
277. Хромосомы - носители генов; нуклеопротеидные нитевидные самовоспроизводящиеся структуры ядра клетки.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
278. Центральная догма - фундаментальный принцип молекулярной биологии, провозглашенный Френсисом Криком в 1958 году. Центральная догма гласит, что передача информации между нуклеиновыми кислотами или от нуклеиновых кислот белкам возможна, а передача между белками или от белков нуклеиновым кислотам. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
279. Центральные вершины (англ. hubs) - элементы графов.
|
280. Четвертичная структура белка - это агрегация двух или большего числа полипептидных цепей, имеющих третичную структуру, в олигомерную функционально значимую композицию.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
281. Штраф за пропуски - штраф, который вычитают из счета подобия последовательностей с целью учета пропусков в выравнивании последовательностей.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
282. Штрафы - очки, или веса, которые в программах построения выравниваний последовательностей служат в качестве коэффициентов для вычисления счетов; такие веса обычно заданы в виде переменных параметров и могут быть изменены пользователем.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
283. Эвристический алгоритм - экономичная стратегия поиска решения задачи, для которой вычисление точного решения практически неосуществимо.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
284. Эдмана метод расщепления - применяемый в секвенировании полипептидов метод, с помощью которого остатки аминокислот последовательно отщепляют от N-конца посредством реакции с фенилизотиоцианатом, приводящей к образованию фенилтиокарбамилпептида (ФТК-пептида). Это соединение расщепляют в безводной кислоте, высвобождая промежуточное вещество тиазолинон и остаток пептида.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
285. Эквивалент генома - такое количество рекомбинантных клонов, суммарная длина вставок в которых равна длине генома.. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
286. Экзон - 1) кодирующая последовательность гена, входящая в первичный транскрипт.; 2) ; [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011; ]
|
287. Экспрессии генов - .
|
288. Экспрессия гена - процесс, в ходе которого закодированная в гене информация преобразуется в структурные и функциональные элементы клетки. К экспрессируемым относятся гены, которые транскрибируются в мРНК и затем транслируются в белок, а также гены, которые транскрибируются в РНК, но не транслируются в белок (например, гены транспортной и рибосомной РНК).. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
289. Эмбриогенез - начальная, зародышевая стадия онтогенеза. Энциклопедия клонов. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
290. Энхансеры - структурные элементы.
|
291. Язык разметки гипертекста (HTML) - HyperText Markup Language. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
292. Ярлык экспрессируемой последовательности (EST) - Expressed Sequence Tag. [сост. Назаров В.В., источник: Огурцов, 2011]
|
